ベニヤのカットによってコストに違いはありますか?

はい。以下は、さまざまな方法での削減コストの大まかな概要を示しています。
ロータリー→フラット→クォーター→リフト（低い順から高い順）
繰り返しますが、これはあくまでも一般的な考え方であり、種によって異なる場合があります。